Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHD4Q14839 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHD4Q14839 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHD4Q14839 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHD4Q14839 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHD4Q14839 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHD4Q14839 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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