Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMCO1Q147U7 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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