Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RFTN1Q14699 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms