Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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