Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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CDH18Q13634 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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CDH18Q13634 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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CDH18Q13634 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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