Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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