Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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