Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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