Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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