Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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