Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms