Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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