Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PKHD1P08F94 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PKHD1P08F94 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms