Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PRAMEF22A3QJZ6 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PRAMEF22A3QJZ6 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PRAMEF22A3QJZ6 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PRAMEF22A3QJZ6 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRAMEF22A3QJZ6 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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