Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TMOD3Q9NYL9 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TMOD3Q9NYL9 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms