Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PHACTR1Q9C0D0 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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