Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ZBED3Q96IU2 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms