Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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