Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAMA3Q16787 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms