Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
FOXD1Q16676 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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FOXD1Q16676 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
FOXD1Q16676 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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