Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms