Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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