Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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