Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms