Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEC23BQ15437 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms