Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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NKX1-1Q15270 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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