Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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