Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
R3HDM1Q15032 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
R3HDM1Q15032 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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