Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIXQ14938 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms