Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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