Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RUNX2Q13950 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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