| RUNX2 | Q13950 | AP002001.2-201 | ENST00000529025 | 1469 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RLIMP1-201 | ENST00000339626 | 1680 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC096751.1-201 | ENST00000515178 | 2202 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AK9-202 | ENST00000355283 | 2499 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00301-201 | ENST00000320202 | 852 nt | TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PMCH-201 | ENST00000329406 | 766 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTTY13-201 | ENST00000330337 | 659 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA60-201 | ENST00000362396 | 134 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-623P-201 | ENST00000363143 | 105 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU5F-7P-201 | ENST00000363696 | 115 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | RNU6-359P-201 | ENST00000365466 | 108 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1207P-201 | ENST00000384343 | 107 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFB108C-201 | ENST00000400154 | 252 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP239-201 | ENST00000410218 | 129 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | OR8F1P-201 | ENST00000425243 | 930 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL929288.1-201 | ENST00000426262 | 746 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356583.2-201 | ENST00000426536 | 280 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL080248.1-201 | ENST00000428954 | 388 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01857-201 | ENST00000429730 | 492 nt | TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023590.1-205 | ENST00000430457 | 676 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162734.1-201 | ENST00000432858 | 157 nt | TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00375-201 | ENST00000433074 | 601 nt | TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS24P1-201 | ENST00000438550 | 371 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UPP2-IT1-201 | ENST00000439185 | 357 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL022238.1-201 | ENST00000442557 | 355 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018359.1-201 | ENST00000442567 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099342.1-201 | ENST00000446399 | 1124 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104308.1-201 | ENST00000454621 | 333 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC123023.1-201 | ENST00000455974 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPX5-203 | ENST00000469384 | 428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01487-202 | ENST00000490497 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LAMTOR3P2-201 | ENST00000504479 | 232 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P22-201 | ENST00000505315 | 124 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC117460.1-201 | ENST00000508964 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF131216.2-201 | ENST00000512316 | 564 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023141.12-201 | ENST00000512399 | 199 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC116347.2-201 | ENST00000514912 | 523 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO1P35-201 | ENST00000515270 | 228 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068672.1-201 | ENST00000520391 | 328 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001330.2-201 | ENST00000523121 | 979 nt | TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC113192.1-201 | ENST00000527270 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018630.1-201 | ENST00000541376 | 925 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL049779.1-201 | ENST00000553306 | 670 nt | TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PWRN1-202 | ENST00000562501 | 642 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012182.1-201 | ENST00000570133 | 895 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090371.2-203 | ENST00000578782 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012603.1-201 | ENST00000606424 | 528 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6868-201 | ENST00000611215 | 58 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLEU2_1.1-201 | ENST00000612089 | 120 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLEU2_1.2-201 | ENST00000614667 | 120 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356585.4-201 | ENST00000623078 | 1229 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP196-201 | ENST00000625967 | 102 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138649.5-201 | ENST00000637456 | 137 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LATS1-201 | ENST00000253339 | 4256 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYP3A7-CYP3A51P-201 | ENST00000611620 | 1608 nt | TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WNK3-202 | ENST00000375159 | 5403 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02120-201 | ENST00000505518 | 2008 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LIG4-201 | ENST00000356922 | 4096 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM126B-202 | ENST00000418596 | 9333 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01505-206 | ENST00000637046 | 4266 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACSM3-201 | ENST00000289416 | 2845 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLHC1-201 | ENST00000401408 | 2248 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591441.1-201 | ENST00000618108 | 2247 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02393-202 | ENST00000614177 | 1993 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKAA2-202 | ENST00000610361 | 9280 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPR171-201 | ENST00000309180 | 1786 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00971-202 | ENST00000484892 | 7308 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEPT7-205 | ENST00000432293 | 1362 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UTRN-204 | ENST00000367545 | 12339 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAPH1-203 | ENST00000374493 | 3909 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNTN6-201 | ENST00000350110 | 3814 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.359-201 | ENST00000365498 | 102 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5V1-215 | ENST00000377154 | 1266 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-629P-201 | ENST00000384061 | 103 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-13P-201 | ENST00000384499 | 162 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356421.1-201 | ENST00000403255 | 413 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CDK8P2-201 | ENST00000415020 | 547 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z97055.1-201 | ENST00000419730 | 712 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391219.1-201 | ENST00000422570 | 483 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5BE1P-201 | ENST00000425977 | 939 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004975.1-201 | ENST00000428733 | 208 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P5-201 | ENST00000433620 | 714 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4LP10-201 | ENST00000435146 | 291 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TBCAP1-201 | ENST00000436520 | 327 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002512.3-201 | ENST00000440231 | 985 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC239367.2-201 | ENST00000447309 | 705 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157359.1-201 | ENST00000449840 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS11P1-201 | ENST00000451072 | 473 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ETV5-AS1-201 | ENST00000453370 | 560 nt | TSL 4 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS20P32-201 | ENST00000456044 | 356 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR9M1P-201 | ENST00000459641 | 921 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103987.1-201 | ENST00000473394 | 348 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114741.1-201 | ENST00000504357 | 464 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02469-201 | ENST00000506460 | 741 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRL3-AS1-203 | ENST00000506704 | 606 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104663.1-201 | ENST00000508555 | 557 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005921.1-201 | ENST00000510589 | 286 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC017037.2-201 | ENST00000513850 | 890 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |