Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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