Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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