Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms