Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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