Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SP140Q13342 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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