Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NME3Q13232 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
NME3Q13232 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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NME3Q13232 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NME3Q13232 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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