Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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FOXD4Q12950 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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FOXD4Q12950 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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FOXD4Q12950 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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FOXD4Q12950 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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FOXD4Q12950 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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FOXD4Q12950 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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FOXD4Q12950 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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FOXD4Q12950 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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FOXD4Q12950 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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