Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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