Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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USP35Q9P2H5 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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