Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRAPPC9Q96Q05 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms