Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BEST4Q8NFU0 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms