Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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