Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAMA3Q16787 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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