Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms