Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SYCP1Q15431 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SYCP1Q15431 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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SYCP1Q15431 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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SYCP1Q15431 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SYCP1Q15431 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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