Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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UBE3CQ15386 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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UBE3CQ15386 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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UBE3CQ15386 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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