Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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