Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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COL9A3Q14050 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
COL9A3Q14050 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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