Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CNGB1Q14028 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms